Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1Q99536 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAT1Q99536 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAT1Q99536 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms