Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOTCH4Q99466 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOTCH4Q99466 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms