Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT12Q99456 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms