Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDRT15Q96T59 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDRT15Q96T59 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDRT15Q96T59 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms