Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARXQ96QS3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARXQ96QS3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ARXQ96QS3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms