Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCNAQ96QF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCNAQ96QF7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNAQ96QF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms