Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3IPQ96QF0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3IPQ96QF0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms