Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC9Q96Q05 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms