Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA5Q96PV4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA5Q96PV4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA5Q96PV4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms