Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIM3Q96PE6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZIM3Q96PE6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms