Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR78Q96P69 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPR78Q96P69 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR78Q96P69 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR78Q96P69 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR78Q96P69 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR78Q96P69 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR78Q96P69 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR78Q96P69 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR78Q96P69 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR78Q96P69 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms