Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE2Q96MF7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms