Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP295NLQ96MC4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP295NLQ96MC4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP295NLQ96MC4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms