Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC114Q96M63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms