Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMX3Q96JJ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms