Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms