Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22AQ96IW7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms