Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNF8Q96H20 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms