Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP3Q96FM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP3Q96FM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms