Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEIL1Q96FI4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms