Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF7

MISP3, Uncharacterized protein MISP3, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3Q96FF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MISP3Q96FF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms