Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO1Q96FE5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO1Q96FE5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms