Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC97Q96F63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC97Q96F63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms