Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC126Q96EE4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC126Q96EE4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms