Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB3CQ96E17 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB3CQ96E17 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms