Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB2Q96DC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms