Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDF1Q96CC6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDF1Q96CC6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms