Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN4Q96CB9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN4Q96CB9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSUN4Q96CB9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms