Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC8Q96B26 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms