Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN3Q969G5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN3Q969G5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms