Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCE1Q969G3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCE1Q969G3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms