Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRF1Q92994 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRF1Q92994 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms