Protein–RNA interactions for Protein: Q92905

COPS5, COP9 signalosome complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS5Q92905 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS5Q92905 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS5Q92905 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS5Q92905 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS5Q92905 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS5Q92905 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS5Q92905 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS5Q92905 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS5Q92905 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS5Q92905 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS5Q92905 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms