Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDEM1Q92611 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms