Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY2Q8WXA3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY2Q8WXA3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY2Q8WXA3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms