Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1Q8WVP7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1Q8WVP7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms