Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKA2Q8WVK7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKA2Q8WVK7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms