Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCTD4Q8WVF5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms