Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM58Q8NG06 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM58Q8NG06 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms