Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA6DQ8NFY4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA6DQ8NFY4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms