Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP35Q8NFH5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms