Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF397Q8NF99 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms