Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA4Q8NEY3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms