Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC112Q8NEF3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms