Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1BQ8NB78 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1BQ8NB78 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1BQ8NB78 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1BQ8NB78 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1BQ8NB78 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDM1BQ8NB78 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1BQ8NB78 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1BQ8NB78 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms