Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMNTD1Q8N9Z9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms