Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms