Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFRP1Q8N474 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms