Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms