Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP3Q8IZU3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCP3Q8IZU3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms